汉成帝建始三年秋天，长安城内流传着大水将要进城的新闻。大将军王凤见城内百姓争相逃命，就劝成帝和太后及后宫嫔妃都躲到船上去。王凤还发起让仕宦登上城楼避水。群臣都附和王凤的意见，只有宰相王商反对。王商认为，大水不可能一日之间突然之间之间之间来到，必然是谣传。不一会，长安城就安定下来。成帝派人查问，果然是谣传。成帝当众称赞了王商，指斥了王凤。从此，王凤对王商挟恨在心。

　　一次，王凤的亲家在当琅邪太守时失职，王商要惩处他。王凤自动找王商说情。王商不徇私情，依然罢免了王凤亲家的官职。王凤采取阴险手段，诬陷王商，成帝轻信王凤的话，罢免了王商的宰相职务。《汉书》作者班固评论说：“王商为人朴实，性格不屈不挠，但最终依然罢官。”